De Holenduif en koolmees maken tijdens het broedseizoen (voorjaar) gebruik van de faunatoren. Vleermuizen en bijen verblijven hier in de zomer en in de winter. In de winter wonen ook de pissebedden/oorwurmen, kikkers en padden in de faunatoren.
De toren is hol van binnen en er is ruimte voor vleermuizen om te zwermen en zich voort te planten. Halverwege zit een vloertje met een ruim gat zonder luik, zodat vleermuizen daar doorheen kunnen vliegen. Er hangen ook vleermuiskasten aan de binnenkant.
De Faunatoren is tot stand gekomen in samenwerking met Provinsje Fryslân, Staatsbosbeheer, gemeente Ooststellingwerf, Buro Bakker (ecologie), Willie Darktrousers (kunstenaar- de slang op de toren), bouwbedrijf Buiteveld, leerlingen van de Tjongerwerven. Het ontwerp heeft Studio JK verder uitgewerkt, wat heeft geleid tot dit eindresultaat.